우리교회 교회학교의 역사는 1958년 교회 창립과 동시에 시작됐다. 주일학교로 시작된 교회학교는 1961년 서대문으로 교회가 이전되면서 더욱 구체화됐다. 초대교장은 조용기 전도사였고, 부장은 이윤상 집사였다.

 교회학교는 이후 여의도 시대가 열리면서 학생수가 기하급수적으로 늘어났다. 그리고 여의도까지 오는 지리적 어려움을 극복하기 위해 지역분교가 설립됐다.

 최초의 지역분교는 1979년 3월에 창립된 용산분교다.

 이태원 지역에 거주하는 아동 및 청소년을 신앙으로 양육하기 위해 설립된 용산분교를 시작으로 현재 8개 지역분교가 세워져 있다. 지역분교는 주일예배는 물론 다양한 프로그램을 진행해 아이들을 그리스도의 대사, 빛의 자녀들로 양육하는데 매진하고 있다. 최근 지역분교에 대한 문의가 많아져 위치와 예배안내를 소개한다.